Colóquios e Seminários

22 de fevereiro de 2016

Colloquium diei: “Magnetos frustrados”

Colloquium_Diei-loguinhoMagnetos frustrados são materiais isolantes nos quais momentos magnéticos localizados, ou spins, possuem interações de troca competitivas que não podem ser todas satisfeitas simultaneamente. Apesar de sujeitos a muitos vínculos, sistemas frustrados apresentam uma grande degenerescência em seus estados fundamentais. Esse comportamento peculiar dá origem a estados da matéria muito interessantes como ordem magnética não colinear, vidros de spin e líquidos de spin. Neste colóquio discutiremos de forma introdutória esses estados exóticos e mostraremos como perturbações em sistema frustrados, especialmente desordem, têm um efeito profundo e dão origem a uma gama de efeitos físicos fascinantes e ainda largamente inexplorados.

15 de fevereiro de 2016

Colloquium diei: “Cosmology with the Planck satellite”

Colloquium_Diei-loguinhoSketched out in 1992, selected by ESA in 1996, and launched in 2009, the Planck satellite was shut off in 2013, after a measuring stage of the mission that collected over a trillion samples and exceeded all expectations. The Planck collaboration delivered a first set of cosmological data and results in March 21st 2013, and the full set in February 2015. Part of the data delivery is a “definitive” map of the anisotropies of the Cosmic Microwave Background (CMB), its angular power spectrum together with its full statistical characterisation, and the implications for cosmology. The 2015 delivery further includes pioneering polarisation maps, spectra, and their analyses.

The temperature anisotropy map displays minuscule variations as a function of the observing direction, of rms ~100microK,  of the fossil radiation around its mean temperature of 2.725K. Other maps reveal the CMB polarisation patterns. These anisotropies are the imprint of the primordial fluctuations which initiated the growth of the large scale structures of the Universe, as transformed by their evolution, in particular during the first 370 000 years. These anisotropies can then be confronted with theoretical expectations.

I will described the results we obtained  so far, both in terms of content of the universe and of characteristics of the primordial fluctuations which are found to match very well with expectations from an early inflationary phase in a Universe filled with cold dark matter and whose expansion recently started to accelerate.

2 de fevereiro de 2016

Seminário Especial: “Molecular mechanisms of tubulin heterogeneity”

Annemarie did her PhD work on the structural and fuctional characterization of mycobacterial Ser/Thr protein kinases sem-especialand phosphatases in the lab of P. Alzari at the Institut Pasteur (Paris; France). She then did a postdoc in the lab of A. Musacchio at the European Institute of Oncology in Milan (Italy) and later at the Max Planck Institute (Dortmund; Germany). At the time the Musacchio lab was a pioneering european lab of integrative biology where both structural and cell biology approaches were used in synergy to address major biological questions. This work was focused on the structural and functional study of a large kinetochore complex (RZZ) involved in chromosome segregation during mitosis and a critical constituent of metazoan kinetochores (KTs).

During the postdoc time in the Musacchio lab she developed independent interests on microtubules and cilia biology, and was awarded a 3-year grant to work on an independent project in the lab of C. Janke at the Institut Curie (Orsay; France). The goal of this project was to work towards understanding the molecular mechanisms and functions of tubulin heterogeneity. The C-terminal domain of tubulin is crucial for determining microtubule identities as it is a hub for both genetically encoded, and post-translationally added tubulin heterogeneity. In order to study how spatially and temporally controlled modification patterns determine the properties and the functional fate of microtubules, we have set out to develop a series of tubulin tools that will allow for a controlled and systematic study of a specific modification of tubulin: glycylation. Annemarie will present the latest results on heterologous expression of recombinant tubulin and functional characterization of a tubulin-modifying enzyme TTLL3.

1 de fevereiro de 2016

A behavioral analysis of cellular automata

Catalyzed by the emergence of modern sem-especialcomputers, cellular automata (CAs) became a full-fledged research domain in the eighties of the previous century. The relevant literature is of a dichotomous nature in the sense that studies either focus on the spatio-temporal dynamics that is evolved by CAs, while others merely use the CA paradigm to build a model for a given biological, natural or physical process. It goes without saying that a profound understanding of CA dynamics is a prerequisite for building realistic, identifiable CA-based models, though this is not straightforward due the fact that a CA is discrete in all its senses (state, time, space). In an attempt to quantify CA behavior in a meaningful and reproducible way, several so-called behavioral measures have been proposed during the last two decades. Here, we will show how Lyapunov exponents and Boolean derivatives can be used to get a complete picture of CA dynamics in the sense that they not only make it possible to unravel the nature of a given CA, but also allow for assessing the effect of changing model design parameters on the CA behavior, an understanding that is a prerequisite for CA-based models to become appreciated as a full-fledged modeling paradigm. Besides, it will be demonstrated that the scope of these measures is not limited to two-state CAs.

1 de fevereiro de 2016

A behavioral analysis of cellular automata

Catalyzed by the emergence of modern sem-especialcomputers, cellular automata (CAs) became a full-fledged research domain in the eighties of the previous century. The relevant literature is of a dichotomous nature in the sense that studies either focus on the spatio-temporal dynamics that is evolved by CAs, while others merely use the CA paradigm to build a model for a given biological, natural or physical process. It goes without saying that a profound understanding of CA dynamics is a prerequisite for building realistic, identifiable CA-based models, though this is not straightforward due the fact that a CA is discrete in all its senses (state, time, space). In an attempt to quantify CA behavior in a meaningful and reproducible way, several so-called behavioral measures have been proposed during the last two decades. Here, we will show how Lyapunov exponents and Boolean derivatives can be used to get a complete picture of CA dynamics in the sense that they not only make it possible to unravel the nature of a given CA, but also allow for assessing the effect of changing model design parameters on the CA behavior, an understanding that is a prerequisite for CA-based models to become appreciated as a full-fledged modeling paradigm. Besides, it will be demonstrated that the scope of these measures is not limited to two-state CAs.

15 de dezembro de 2015

Seminário do Grupo de Óptica: “Nanomateriais teranósticos: sistemas multifuncionais para aplicações”

Seminrios_GO-loguinhoNanomateriais multifuncionais que combinem funções terapêuticas e de diagnóstico em um único complexo nanoestruturado, chamados de “teranósticos”, têm se mostrado interessantes para diversas aplicações, principalmente no diagnóstico precoce e tratamento de doenças como câncer. A possibilidade de obter nanopartículas de ouro em uma grande variedade de tamanhos, formas e funcionalizações permite o controle das suas propriedades e tem aberto novas possibilidades para aplicações no diagnóstico e tratamento de doenças. Estas partículas podem ser projetadas para converter eficientemente luz em calor e eliminar seletivamente células malignas em um conceito chamado fototerapia. Neste trabalho, nanopartículas teranósticas foram desenvolvidas por meio do encapsulamento de agentes quelantes de Gd(III) entre duas camadas nanoestruturadas de ouro. Mais especificamente, nanopartículas de ouro de aproximadamente 50 nm foram recobertas com uma camada intersticial de SiO2 dopada com quelantes de Gd(III) seguido de um recobrimento adicional com uma camada de ouro. Essas partículas, chamadas Gd-Nanomatryoshkas, apresentaram banda de ressonância plasmônica na região do infravermelho próximo, ideal para aplicações in vivo uma vez que essa região permite máxima penetração da radiação através dos tecidos. Ao mesmo tempo, Gd-Nanomatryoshkas exibiram elevada sensibilidade para aplicações como agentes de contraste em imagens de ressonância magnética devido ao acúmulo de íons de Gd(III) nas partículas, além de reduzir a potencial toxicidade associada aos íons Gd(III) prevenindo sua liberação in vivo por meio de uma camada de ouro protetora. Este novo sistema multifuncional pode permitir não só o diagnostico e tratamento de tumores sólidos, mas também o rastreamento das partículas in vivo, uma etapa essencial para melhorar a eficiência e segurança dos nanomateriais.

14 de dezembro de 2015

Seminário do Grupo de Óptica: “Optical Imaging Technologies for Clinical”

Seminrios_GO-loguinhoIn this seminar, we will provide an overview of our current efforts to develop optical instrumentation and computational methods for both pre-clinical and clinical applications. In particular, we will discuss two ongoing projects. The first project is focused on developing Fluorescence Lifetime Imaging (FLIM) endoscopes that could be used for oral cancer diagnosis. The second project is focused on combining FLIM with Optical Coherence Tomography (OCT) for intravascular imaging of coronary plaques to study mechanisms of coronary atherosclerosis development.

4 de dezembro de 2015

Colloquium diei: “Física de precisão com o lépton tau”

O tau é o lépton mais pesado: sua massa é cerca de 3500 Colloquium_Diei-loguinho-150vezes maior que a do elétron. Os decaimentos do tau podem ser calculados e medidos com grande precisão e constituem um excelente laboratório para diversos aspectos da física de partículas, tanto no contexto do modelo padrão, como além. Em especial, por ter massa suficiente para decair em hádrons, os decaimentos do tau são muito úteis em estudos de cromodinâmica quântica (QCD). Nesse colóquio vamos discutir a física de precisão que pode ser feita com esses decaimentos, com ênfase em aspectos da QCD, como a determinação precisa do acoplamento forte, alpha_s.

3 de dezembro de 2015

High energy physics seminars: “Internal structure of the B meson”

High_energy_physics_seminars-_loguinhoWe report on a two-flavor lattice QCD study of the axial, charge and matter distributions of the B meson and its first radial excitation. As our framework is the static limit of Heavy Quark Effective Theory, taking their Fourier transform gives access to several form factors at the kinematical point q^2=0. Moreover they provide some useful information on the nature of an excited state: either a radial excitation of a quark-antiquark bound state or a multihadron state.

30 de novembro de 2015

Seminário do Grupo de Óptica: “Efeitos da terapia fotodinâmica na descontaminação sanguínea”

A infecção na corrente sanguínea, também Seminrios_GO-loguinho-150conhecida como sepse, é um problema de saúde relacionado, principalmente, à dificuldade de detectar bactérias, identificá-las e tratar os pacientes com antibióticos adequados na fase inicial de infecção. É desencadeada por algum tipo de infecção grave que culmina na contaminação do sangue por bactérias. Estudos têm mostrado um aumento na incidência de sepse ao longo dos anos e isso se deve, sobretudo, ao aumento da resistência dos microrganismos aos antibióticos, uma vez que tais medicamentos são ainda utilizados erroneamente e vendidos de forma inadequada. Os principais objetivos deste estudo foram descontaminar o sangue utilizando a terapia fotodinâmica como técnica antimicrobiana e avaliar os efeitos dessa terapia sobre as células sanguíneas. O microrganismo alvo de inativação foi o Staphylococcus aureus, bactéria Gram-positiva, muito frequente em contaminação sanguínea. Foram analisados os efeitos isolados do FS Photogem® e da luz 630 nm, além do efeito fotodinâmico nas células sanguíneas. A avaliação das células sanguíneas foi realizada por meio de hemogramas e esfregaços sanguíneos corados com May Grünwald-Giemsa, analisados em microscopia óptica. Ensaios de hemólise foram executados para avaliar a porcentagem de hemólise em eritrócitos após cada tratamento. A sobrevivência de S. aureus foi avaliada por contagem das unidades formadoras de colônias (UFC/mL) em meio de cultura TSA. Os resultados mostraram normalidade nos eritrócitos, bem como nos glóbulos brancos, em todas as condições analisadas, uma vez que não foram observadas mudanças morfológicas nestas células. Os experimentos in vitro com S. aureus em co-cultura com sangue mostraram cerca de 90% de inativação do microrganismo. Em relação à hemólise, apenas os eritrócitos que receberam irradiação na presença do Photogem® (TFD) sofreram hemólise (< 20%) nas maiores concentrações do FS e maiores doses de luz. De acordo com os resultados, observou-se que o FS, na presença de sangue e microrganismo, apresentou maior afinidade pelas moléculas presentes no sangue do que pelo microrganismo, dificultando a inativação de S. aureus neste ambiente celular.

30 de novembro de 2015

Colloquium diei: “Física de precisão com o lépton tau”

O tau é o lépton mais pesado: sua massa é cerca de 3500 Colloquium_Diei-loguinho-150vezes maior que a do elétron. Os decaimentos do tau podem ser calculados e medidos com grande precisão e constituem um excelente laboratório para diversos aspectos da física de partículas, tanto no contexto do modelo padrão, como além. Em especial, por ter massa suficiente para decair em hádrons, os decaimentos do tau são muito úteis em estudos de cromodinâmica quântica (QCD). Nesse colóquio vamos discutir a física de precisão que pode ser feita com esses decaimentos, com ênfase em aspectos da QCD, como a determinação precisa do acoplamento forte, alpha_s.

26 de novembro de 2015

Café com física: “Correlation functions of integrable quantum spin chains”

Caf_com_fsica-loguinhoIntegrable systems like the spin-1/2 Heisenberg chain provide the rare opportunity of calculating exact results like energies and thermodynamics for finite size and in the thermodynamic limit. We know many integrable systems for many decades, but actual calculations of physical properties have only rather recently been done if at all.

A notorious problem is posed by the computation of correlation functions. For the infinite volume system, even static correlators present a major challenge. Currently, we know how to calculate short range correlators for the spin-1/2 Heisenberg chain at arbitrary temperature and magnetic field, where the first results for zero temperature and zero magnetic field have been obtained about 20 years ago. A central result of Jimbo, Miwa, Smirnov and others is the factorization of general static correlators into sums over products of nearest-neighbour correlators similar to the Wick theorem for ideal quantum systems however with much more complicated structure factors.

There are applications in the field of non-equilibrium systems such as interaction quenches. I will talk about applications of the computational methods for thestudy of the stationary state approached through the equilibration process. A major subject of my talk will be the generalization of the study of correlation functions in direction of higher spin-S chains with su(2) symmetry and into the direction of higher rank symmetry like su(3).

24 de novembro de 2015

Journal club: “Describing molecular systems with Reactive Methods”

JC-_loguinhoThe description of molecular and nanoscopic systems became an important area for research in the last few decades. This is due to the scientific interest in the improvement of our understanding of physical properties of existing materials and to the possibility of predicting new materials with special properties. In order to model these systems atomistically in a proper way, the use of quantum mechanical methods is frequently required. Despite the fact that these methods are highly successful in many cases, the associated computational cost is typically O(N³) or higher, depending on the specific approximations implemented. This characteristic poses serious limitations on the number of atoms that can be considered during a calculation and brings the necessity of using high performance computers, even for the simulation of relatively small systems. On the other hand, the alternative approach, namely the use of classical methodologies, is usually incapable to describe some important aspects of atomistic systems, like chemical reactivity, polarization and bond breaking or bond formation. In this context, an intermediate approach that could somehow bridge this gap between quantum and classical methods is desirable. For this end, there is the Reactive Force Field (ReaxFF), created by Adri van Duin and collaborators (J. Phys. Chem. A, 105 (2001), pp. 9396–9409), which consists of a reactive potential, parametrized with ab initio calculations. This potential, based on an empirical bond order methodology, is highly transferable and is able to mimic some quantum effects, like the creation or breaking of chemical bonds. The relatively low computational cost, if compared to quantum methodologies, makes it suitable for the description of chemical reactions and dynamical simulations of systems with tens of thousands of atoms using relatively modest computational resources. During the presentation, we will describe the ReaxFF potential and some recent applications to atomistic systems. We will also discuss briefly the methodology used in the development of new parameters for specific systems.

24 de novembro de 2015

Seminário do Grupo de Óptica: “Estudo da Curcumina para o tratamento da onicomicose”

Seminrios_GO-loguinhoA onicomicose é a doença comum na lâmina ungueal, constituindo aproximadamente metade de todos os casos de infecção na lâmina ungueal. O tratamento convencional consiste na administração sistêmica de antifúngicos e antibióticos por períodos de até 24 meses. O aumento de linhagens microbianas resistentes às drogas disponíveis e a alta incidência deste tipo de infecção na população tornam importante o desenvolvimento de novas tecnologias e opções terapêuticas. Neste contexto apresentamos a Terapia Fotodinâmica (TFD) consiste no emprego do composto fotossensibilizador (FS) ativado por luz em comprimento de onda adequado que, na presença de oxigênio, produz espécies reativas de oxigênio tóxicas que inativam as células alvo (fungos e bactérias). Este estudo teve como objetivo analisar a curcumina como FS utilizando diferentes tipos e marcas de curcuminas, assim como estudos fotofísicos e ensaios in vitro. Estudar mecanismos que auxiliam na penetração do FS lâmina ungueal através da utilização de emolientes e novas formulações farmacêuticas. Auxiliar no diagnóstico da doença por imagem infra-vermelho e fluorescência. Tratar os pacientes com onicomicose TFD, com o auxilio de um dispositivo desenvolvido especificamente para esse fim. Os resultados in vitro mostraram que as curcumina tiveram um boa estabilidade fotofísicas, e o melhor resultado foi quando utilizamos a mistura de curcumina e curcuminoides, por PDTPharma®. Os resultados clínicos foram excelentes com a média de 6 sessões de TFD, quando utilizamos a curcumina incorporada em emulsão e média 10 sessões quando em gel. Confirmando a eficácia da TFD utilizando a curcumina como FS para o tratamento da onicomicose. Além disso, o baixo custo do equipamento desenvolvido, a simplicidade de operação são fatores importantes a serem considerados para garantir a implementação desta tecnologia como um tratamento para tal comum infecção.

20 de novembro de 2015

Colloquium diei: “Oscilação de Neutrinos e o Experimento NOvA”

Colloquium_Diei-loguinhoNeutrinos são as partículas de massa mais abundantes do Universo. Não obstante, conhecemos pouco sobre elas. Nesse ano, o prêmio Nobel foi concedido a físicos que lideraram experimentos que contribuíram para confirmar o modelo de oscilação de neutrinos e, consequentemente, a massa dos neutrinos. Apresentamos uma descrição do modelo de oscilação e evidências experimentais que refutaram outros modelos. Também apresentamos o potencial do experimento NOvA para as principais questões de neutrinos (hierarquia de massa, octante de theta_23, e violação de CP), bem como nossos primeiros resultados de desaparecimento de neutrinos muônicos e de aparecimento de neutrinos eletrônicos. Nossos resultados são baseados em menos de 10% dos dados esperados para o NOvA e, ainda assim, já se mostram competitivos com os resultados de outros experimentos.

19 de novembro de 2015

High energy physics seminars: “Vector boson scattering at the LHC”

High_energy_physics_seminars-_loguinhoIn this work we study WW scattering at the LHC in the same- and opposite-sign channels under the assumption that no resonances are present in the LHC processes pp → W W j j. New physics is parametrized by means of effective operators. We combine for the first time in a detailed analysis standard selection cuts together and the recent proposed Warsaw cut (a restriction on the combination of the final lepton and jet momenta). This combination of cuts makes it possible to argue that at the LHC, at center-of-mass energy of √s = 13 TeV, a luminosity of 100 fb−1 will be sufficient to constrain the two leading effective lagrangian coefficients at the permil level, improving the existing expected limits. We also discuss limits on the coefficients of the other effective operators as well as stronger constraints provided by higher luminosity.

19 de novembro de 2015

Café com Física: “Considerações teóricas sobre o efeito Aharonov-Bohm”

Após recordar o efeito Aharonov-Bohm, vamos Caf_com_fsica-loguinho_cpia-100discutir questões teóricas e de fundamentos deste importante efeito. Será discutido um mecanismo para justificar a escolha de uma condição de fronteira no solenóide. Então será proposta uma situação em que não há interação com o solenóide e como verificar quantitativamente o efeito (trabalho ainda em andamento). A atenção é em resultados matematicamente rigorosos, mas detalhes técnicos serão evitados por nos parecer que não combinam com café.

 

18 de novembro de 2015

Seminário do Grupo de Óptica: “THz radiation: generation mechanisms and applications”

Seminrios_GO-loguinhoTHz radiation sources with tunable output can be utilized for spectral imaging and spectroscopy, with particular interests in medicine, industry and homeland security. Electromagnetic field in the terahertz portion of the spectra is extremely difficult to generate and detect. In this talk, an overview of the most successful approaches to overcome these challenges will be given. Additionally, state-of –the-art sources and applications will be presented.

13 de novembro de 2015

Colloquium diei: “Grafos para Contextualidade, Grafos Coloridos para Não-localidade”

Colloquium_Diei-loguinhoA teoria quântica alia duas características instigantes: sucesso preditivo e fundamentação controversa. Uma das mais dramáticas distinções entre a teoria quântica e teorias clássicas está a não-localidade, no sentido de John Bell: experimentos de correlação entre partículas distantes podem exibir correlações inconsistentes com noções muito básicas que acompanharam o pensamento ocidental por séculos. Ainda que a não-localidade seja a versão mais dramática dessa distinção entre correlações clássicas e quânticas, ela é só um caso particular do que se chama contextualidade. Nessa palestra pretendemos explicar o que é contextualidade, apresentar surpreendentes contribuições da teoria de grafos ao estudo de contextualidade em geral e não-localidade, em particular, abordando de maneira introdutória trabalhos recentes e futuros.

13 de novembro de 2015

Café com física: “Atomic-scale magnetometry of dynamic magnetization”

Caf_com_fsica-loguinhoThe spatial resolution of imaging magnetometers has benefitted from scanning probe techniques. The requirement that the sample perturbs the scanning probe through a magnetic field external to its volume limits magnetometry to samples with static moments. We propose a magnetometer in which the perturbation is reversed; the probe’s magnetic field generates a response of the sample, which acts back on the probe and changes its energy. For an NV$^-$~spin center in diamond this perturbation changes the fine structure splitting of the spin ground state. Sensitive measurement techniques using coherent detection schemes then permit detection of the magnetic response of paramagnetic and diamagnetic materials, including especially superconductors. This technique can measure the thickness of magnetically dead layers with better than 0.01 nm accuracy.

 

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Instituto de Física de São Carlos - IFSC Universidade de São Paulo - USP
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